Bioystadegau a biowybodeg

Mae ein gwaith yn canolbwyntio ar ddadansoddi llawer iawn o ddata biolegol er mwyn helpu i ddeall achosion clefydau sy'n gysylltiedig ag iechyd meddwl.

Yn ystod y blynyddoedd diwethaf, bu cynnydd amlwg ym maint a chymhlethdod data genomig sydd ar gael i ymchwilwyr. Mae gan y mewnlifiad hwn o wybodaeth y potensial i gynhyrchu mewnwelediadau pwysig i'r prosesau biolegol sy'n sail i anhwylderau genetig.

Fodd bynnag, mae maint a chyfoeth y data newydd hwn yn peri heriau sylweddol o ran dadansoddi, storio data a chyfrifiannu. Mae ein huned bioystadegau a biowybodeg (BBU) yn gweithio i ateb yr heriau hyn, gan ddatblygu dulliau a thechnegau newydd i ganiatáu ymchwil i elwa o'r cyfoeth hwn o ddata.

Ein hymchwil bioystadegau a biowybodeg

Mae ein hymchwil yn cwmpasu'r meysydd canlynol, sy'n rhychwantu'r holl grwpiau ymchwil yn y CNGG:

Dadansoddiad o amrywiad genetig cyffredin (SNP)

Rydym wedi cynnal astudiaethau cysylltiad genom-gyfan (GWAS) ar samplau mawr o anhwylderau niwroddirywiol a seiciatrig, yn benodol sgitsoffrenia, ADHD, clefyd Alzheimer sy'n dechrau’n hwyr a chlefyd Huntington.

Dadansoddiad o amrywiad genetig prin

Rydym hefyd yn dadansoddi data sglodyn ecsom a dilyniannu i ddarganfod amrywiadau prin unigol sy'n gysylltiedig â risg clefyd, gyda diddordeb arbennig mewn amrywiadau denovo. Rydym hefyd yn astudio amrywiadau rhif copi prin (CNVs) ar gyfer cysylltiad â chlefyd, mewn samplau rheoli achos a denovo.

Integreiddio data biowybodeg gyda data genetig

Mae gennym ddiddordeb arbennig yn natblygiad a chymhwysiad dulliau i brofi ar gyfer cyfoethogi signal genetig mewn setiau genynnau (llwybrau). Gellir cael y rhain o gronfeydd data neu drwy brofi mynegiant neu rwydweithiau rhyngweithio protein. Mae'r dulliau hyn wedi cael eu cymhwyso’n llwyddiannus i astudiaethau GWAS a CNV.

Agregu amrywiad genetig

Rydym wedi datblygu methodoleg ar gyfer agregu amrywiad genetig ar y lefel gennyn a llwybr, ac wedi defnyddio hwn o fewn clefydau i ddod o hyd i loci rhagdueddiad newydd ac ar draws clefydau i ganfod rhagdueddiad genetig a rennir. Ar hyn o bryd, mae gennym ddiddordeb mewn datblygu dulliau i gyfuno gwahanol fathau o amrywiad genetig (SNPs, amrywiadau denovo, CNVs) i mewn i un dadansoddiad.

Dadansoddiad ffenoteip

Mae'r dulliau dadansoddi genetig a ddisgrifir uchod yn cael eu cymhwyso i gyfoeth o ddata clinigol a ffenotypig, yn enwedig data delweddu.

Cydweithrediadau

Mae ein haelodau'n weithgar mewn nifer o gonsortia rhyngwladol, yn enwedig y Consortiwm Genomeg Seiciatrig (PGC), y Prosiect Genomeg Clefyd Alzheimer Rhyngwladol (IGAP) a'r Consortiwm Genomeg Clefyd Parkinson Rhyngwladol (IPDGC).

Addysgu a hyfforddi

Yn ogystal â'n cynnyrch ymchwil, rydym yn cymryd rhan weithredol mewn hyfforddi myfyrwyr ac ymchwilwyr drwy'r MSc mewn Biowybodeg ac Epidemioleg Genetig